Il est le maître du cloître, ses valets y sont toujours et on n’y entend que des chansons déshonnêtes". Ce mémoire qui fut dressé contre l’abbé de Pontaut, ne dit pas que cet abbé fut religieux.  

Après avoir reconstitué une partie de leur patrimoine dévasté à Mant, Monget, Monségur, Peyre, Malaussanne, Philondenx, Bassercles, les moines vont connaître de nombreuses difficultés principalement du fait des abbés commendataires. En mars 1622, le Parlement de Bordeaux oblige l’abbé commendataire à fournir les ornements nécessaires pour l’église. En 1627, l’abbé de Citeaux décide que 400 livres seraient annuellement délivrées pour la réparation du cloître. L’ère des procès à l’intérieur de l’abbaye s’ouvre bientôt avec les prieurs. En 1650, un notaire fit un inventaire détaillé des meubles et objets existant à Pontaut. Le couvent possédait au milieu du XVIIème siècle, un mobilier relativement complet, mais souvent en mauvais état.

 Dans la prison on enfermait les malfaiteurs de la contrée.  Les communs comprenaient de nombreux bâtiments : réfectoire, cuisine, chambres, etc.

 L’Abbaye possédait la forêt qui couvrait les rives du Luy, de Monget à Poudenx par Mant, Peyre, Monségur, de très nombreuses métairies et des prairies. Elle percevait des rentes payables le 1er novembre à raison de 9 deniers la "journée" de terre, des droits seigneuriaux sur des maisons à Hagetmau et la dîme dans de très nombreux villages.

En 1790, les revenus de l’Abbaye s’élevaient à 13 884 livres, les dépenses à 8 933 livres. L’excédent était donc de 4 931 livres.

Déclaration de l’état des biens formant l’abayie de Pontaut, dont nous, Jean Louis de Viella Frère Chanoine vicaire général de Lescar et Viviers Abbé Commandataire de la dite abayie de Pontaut habitant la dite ville de Lescar faisons devant M M les Officiers de Pontaut, par le ministère du Sr Jacques Ferrier Négt à Pau, mon procureur fondé.